控制方式上分有五种，分为手动控制型、电气自控型、电脑自控型、电脑半自动控制型、电脑全自动控制型（远程控制型）等五种。

手动控制型：

所有阀门和水泵均由手动控制，包括加水、升温、保温、降温等工序。

电气半自动型：

压力由电接点压力表(一表控两阀，补气阀和排气阀）控制，温度由传感器（pt100）和进口温控仪控制（精度为±1℃），降温过程由人工操作。

电脑半自动型：

采用PLC和文本显示器将采集的压力传感器信号和温度信号进行处理，可以储存杀菌工艺，控制精度高，温控可达±1℃，（主要控制补气，排气，温度，时间）温过程由人工操作。

电脑全自动控制型：

全部过程都有PLC和触摸屏控制，可以储存杀菌工艺，操作工只需按启动按钮即可，杀菌完毕后自动提示，温控精度可达±0.5℃。（整个杀菌过程形成了数字化，机械化）基本上达到了一指通。（除去进出货物和开关锅门）

电脑全自动控制型（远程控制型）：

在电脑半自动的基础上，整机和前后的输送线自动连接，整机具备自动进出料，自动开关锅门，锅内导轨可前后自动伸缩，（整机达到了数字化，机械化）可形成远程控制或操作，为车间的无人化操作鉴定基础。远程控制的使用为售后服务节省了时间。